第六種情形是身體還有其他疾病也可能引起陽萎，例如肝硬化，因為硬化後肝功能很差，無法將男性體內之女性賀爾蒙代謝，造成女性賀爾蒙過多而有陽萎現象產生。另外，如慢性腎衰竭的病人可能會發生性腺分泌不足的情形，也會有陽萎。當然，癌症的病人也可能因為體力不佳、營養不良或疼痛而造成陽萎。
性器官本身的問題造成性功能障礙也偶而有之，例如尿道下裂時，陰莖短小彎曲，無法進入女性陰道，或因陰莖本身長了些硬結節，使得勃起時產生疼痛、側彎情形也會造成陽萎；另外，性器官本身長腫瘤破壞了勃起組織及神經一樣也會造成陽萎的。
至於性功能障礙應該如何診斷呢？其實，病患已經告訢你了，但是他的陽萎究竟是心理性還是器官性呢？如果是器官性，那麼是什麼原因引起的呢？這就必靠詳細的病史訊問及身體檢查，還有就是一些特殊的檢查了。
在區分心理性或器官性的因素方面，最簡單的方法是問一問病患在夜間時是否有勃起現象，如果沒有也不表示絕對有障礙，因為男性的勃起都發生在睡眠時的深睡期且伴隨著眼球快速運動。正常的勃起大約可以維持20-30分，但是如果不是在這個深睡期醒來時，不一定會發覺有勃起，所以，有人使用貼郵票法，也就是晚上睡覺時，在陰莖上套上一環狀紙，如果第二天醒來時，發現這環狀紙已撐裂或斷掉，即可證實有勃起。
但是，這是比較粗淺的檢查方法，最近有一種更進一步的檢查，叫做“夜間陰莖勃起試驗”方法，是將兩個套環分別套在陰莖根部及冠狀溝處，然後將陰莖整晚的活動情形都記錄下來，除了可以分別陽萎是心理性或器官性外，還可以獲知更多的訊息，例如究竟每晚勃起了幾次？每次勃起的時間維持多久？陰莖硬度如何？它的粗度又如何等等，是一種相當實用的檢查方式。
如果發現夜間陰莖勃起試驗的結果不正常，例如：勃起不全，或根本無勃起現象時，就必須考慮是器官的因素了，這時候可以接受“生物震動感”儀器的檢查，看看陰莖對震動的感應如何，以了解神經的狀況，但是最常實施的檢查還是著重於血管方面。
對於懷疑有動脈血管的問題時，可以做“陰莖杜卜勒超音波”檢查，看看供應陰莖血流的動脈，在勃起前及勃起後管徑的變化，如果無法勃起可以注射藥物使陰莖勃起，每秒鐘陰莖動脈的最大血流速率等，來測知是否有動脈供血不足，如果懷疑靜脈漏血，則可以做“陰莖海綿體攝影”檢查，看看是一條或數條靜脈血管漏血，以作為以後靜脈結紮的參考，當然，抽血檢驗血中賀爾蒙濃度、腎功能、肝功能、血糖等數值也是相當重要的。
至於陽萎的治療，端視病患的年齡與態度而定了，一般而言，心理性的陽萎應先請教精神科醫師，由他來為您解決心理上的問題，另外，充足的睡眠，適當的營養，心情的放鬆，氣氛的營造及培養也是必須注意和學習的。
如果是器官的因素，一般都是先服用些血管擴張劑以期能增加陰莖的血流量，對於賀爾蒙缺乏的病患則必須格外小心，一則因為賀爾蒙長期服用或注射容易造成睪丸的萎縮，所以每隔一段時間就應該測知血中賀爾蒙的濃度，如果已經達到標準時，最好勿再長期使用；二則是男性賀爾蒙可能會對攝護腺肥大或攝護腺癌造成不良的影響；三則長期口服男性賀爾蒙會損及肝臟功能。
如果藥物無法達到效果，可以考慮使用海綿體藥物直接注射，效果一般都有不錯的反應，但是，對於靜脈漏血的患者及年輕人、性生活較頻繁的人則較不適用。另外，還有一種非手術的治療方式，是在欲行房前，利用陰莖真空抽吸器，將陰莖被動勃起以達到“完事”的目的，有部份患者會有不自然，射精困難及陰莖皮下點狀出血的困擾。
手術治療方面，第一就是動脈的問題，可以做血管移植，將狹窄、硬化的動脈切除換上較粗、較健康的靜脈以增加陰莖血流量，但工程較困難，且有血管再狹窄的顧慮。如果是靜脈漏血可以作靜脈結紮，將漏血的血管綁住，較適於年輕人，但兩年的成功率大約只有50％。
最近在歐美較流行的方式是所謂“人工陰莖植入術”，也就是在陰莖海綿體內植入各種不同材質的東西使陰莖勃起，但是，國人似乎對此手術的接受度不高，但幾乎所有的陽萎最後都可以用人工陰莖植入解決問題，唯其必須考慮的因素較多，一般而言，在做這類手術前有下列幾點要先考慮清楚的：
1.年輕人或年紀太大的病人儘量避免。
2.除非其他方式治療都無效時用。
3.必須告知病患這種治療方式並非萬無一失，可能因為機件故障或產生合併症，如人工陰莖穿孔脫出或發炎、疼痛，而需要將人工陰莖拿掉。
4.這是一條不歸路，萬一失敗，可以說沒有其他方法再讓陰莖重振雄風。
5.最好也獲得性伴侶的認可。
總之，性這回事端看每個男人如何看這件事，有人認為年齡大了，可有可無，有人確認為是男人第二生命，無比重視，尤其事業有成而“那個”確不爭氣，實在有煞風景，了解陽萎的成因，知道如何選擇正確的醫師，由他來為您找出病因，提供正確的性觀念及態度和適當的治療，才是最重要的。