西元 1895 年滿清政府甲午戰爭失敗，割讓臺灣給日本，日本軍隊進入臺灣，當年即在臺北大稻埕設立「臺北醫院」，後來多次遷建逐漸演變成為今天的「臺大醫院」。1897 年成立「臺北醫院附設醫學講習所」，成為今天的臺大醫學院的濫觴。
前者於 1899 年改變為「臺灣總督府醫學校」，1919 年成立「臺灣總督府醫學專門學校」，1927 改為「臺灣總督府臺北醫學專門學校」。1928 開辦臺北帝國大學，1936 前者改為「臺北帝國大學附屬附屬醫學專門部」，並設立「臺北帝國大學醫學部」，兩者皆四年制學程。1939 設立「臺北帝國大學附屬熱帶醫學研究所」。
1945 年日本戰敗，國民政府接收臺灣，分別改隸為「國立臺灣大學醫學院」及「國立臺灣大學屬熱帶醫學研究所」，前者有五、六、七年制；後者於 1951 年分成「臺灣大學公共衛生研究所」及「細菌疫苗研究所」。
1945 年至 1950 年臺灣改朝換代，環境破壞，生活匱乏，社會動盪，民心不安。臺大處在混亂受難與失序的時代，歷經戰爭結束前的空襲疏散與戰後的復原。臺大醫學院與臺大醫院，開始去日本化，進入中國化，並接受美式教育的影響。逐漸蛻變，浴火重生。
在這段混亂的年代，臺灣歷經二二八事件、四六事件、戒嚴及白色恐怖。這 5 年中臺灣大學換了 4 位校長，臺大醫學院歷經 3 任（2 位）院長，臺大醫院歷經 3 位院長。醫學教育制度，從四年、五年、六年，最後演變到七年（包括第七年的實習醫師）。從日籍教職員的留任與遣返，臺大醫院出現破傷風與罷診的重大事件。從前以教授為主導的教室制，逐漸變成科部制。
前臺大地質系王源教授說：「自 1945 年期的 5 年間，對臺灣大學來說是非常混亂的一個時代，也是一個受難、失序的時代。」臺大醫學院與臺大醫院的同仁們，如何在混亂失序中，堅強的存活下來，不斷追求卓越，期望貢獻這個醫學院於世界，這段歷史值得大家回顧。
1945～1950 年是臺大醫學院在短時間內歷經最大變革與震動的年代，如何傳承以前的歷史，創造後代的歷史，其中發生的種種事情，參與這段歷史的眾多先賢的史蹟，值得後人保存與學習。有歷史的傳承，才有後人更大的成就與貢獻。
臺大歷史系出身的張秀蓉教授，長年從事中國近代史近代、歐洲社會經濟史、香港史與臺灣史史料研究，曾任臺大歷史系教授及系主任。退休後致力於臺灣醫療公衛史研究。經過張教授多年的努力，「從故紙堆中建構歷史」，終於在 2013 年 4 月完成這本醫學史巨著：《臺大醫學院 1945～1950》，由臺大出版中心出刊。其中有血有淚，有憤慨，也有感動，值得關心這段歷史及關心醫學發展的普羅大眾或學者專家，人手一冊，細心閱讀。
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