女性荷爾蒙主要有兩種，動情素與黃體素，主要有治療效果的是動情素，黃體素是用來預防子宮癌的。

在停經的最初幾年，骨質流失的特別快，尤其是瘦的女性更易形成骨質疏鬆，因此荷爾蒙的治療要儘早開始，據研究可減少一半以上的骨折發生，服用天然荷爾蒙至少每天要0.625毫克才能達到防止骨質流失的效果，黃體素不會降低動情素對骨頭的好處，將鈣片，適當的運動，荷爾蒙，一起運用可達到最佳的治療效果，荷爾蒙治療可一直持續到八十歲。

在心臟血管方面，動情素可上升血中好的脂蛋白，有助於清除血管壁上的膽固醇，也可降低壞的脂蛋白，使膽固醇不容易沉澱在血管壁上，研究指出，動情素可減少一半以上的心肌梗塞，黃體素會輕微降低動情素對心臟血管的好處，這也是為什麼黃體素要每月給10到 14 天的原因，太少無法預防子宮內膜癌，太多則抵消了動情素的好處。

大部分的研究認為動情素並不會增加乳癌的發生，少數研究認為動情素僅造成乳癌發生率極輕微的上升，動情素並不會造成高血壓，停經荷爾蒙治療的副作用比口服女性荷爾蒙避孕藥要小，可能是因為停經後身體好的荷爾蒙減少，把它補充回來，算是相當自然的治療。

荷爾蒙的給法有很多種，常用的一種是看日曆為準，每月1-25 號服用動情素，每月14-25 號同時服用動情素與黃體素，這與婦女年輕時的身體荷爾蒙較為相似，前半個月動情素較多，後半個月排卵之後，身體中荷爾蒙以黃體素為主，25-30 號都不吃荷爾蒙給乳房及身體一個喘息的機會。

有些情形不適合吃荷爾蒙，如陰道出血，乳癌，肝癌，大腸癌，子宮內膜癌，皮膚癌，血栓症，腦中風，肝炎等，因荷爾蒙對胎兒有害，荷爾蒙療法之前，如有性行為，應該要驗孕。

荷爾蒙的副作用，最常見的為月經再度發生，通常在給予黃體素10-12天後，若每月繼續服藥，一般八個月左右出血也會消失，年齡較大的婦女較少見，出血量大，或持續不止，須進一步做子宮超音波檢查，子宮內膜病理檢查。動情素主要副作用為乳房腫脹，每月停藥五日，使乳房有消腫的機會，黃體素開始服用時，可能會造成頭痛，情緒緊張，或心情低落，繼續服用一般就消失。

荷爾蒙療法，好處遠多於壞處，如沒有特別原因，可常規建議婦女使用。