流感疫苗及肺炎鏈球菌疫苗從去年（2013）開打，疾病管制署說兩項疫苗可同時接種，建議右手施打肺炎鏈球菌疫苗，左手接種流感疫苗，可獲得雙重保護。而最新的研究報告指出，年幼的孩子若同時接種這兩種疫苗，會增加暫時性體溫升高的風險，家長應留意。

哥倫比亞大學（Columbia University）針對 530 位年齡從 6 個月到 23 個月的嬰幼兒，調查疫苗接種後的身體狀況，這些小孩有同時接種也有分次接種。結果發現同時接種疫苗的孩童，約有 38%出現發燒的情形，體溫達 38℃以上，相比之下，單獨接種肺炎球菌疫苗或流感疫苗的小孩，出現發燒的情形較低，各為 9.5%與 7.5%。

另外他們還發現，每 100 人中，同時接種兩種疫苗出現發燒的人數，比只接種一種疫苗的增加 20~23 人；而發高燒（39℃以上）的人數則增加 15 人。

根據台灣疾病管制署的網站，流感疫苗提供給 6 個月以上到國小 6 年級的小孩，肺炎鏈球菌疫苗（PCV13）則提供給 2~5 歲幼童。研究人員表示，這些疫苗所給予的好處仍大於發燒風險，因為在大多數情況下，體溫升高是短暫的，但父母應被告知，當他們的孩子同時接種流感及肺炎鏈球菌疫苗，可能會有發燒的情形發生。